多重比較Multiple comparisons - 研究生2.0
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Tukey HSD 是測試所有可能的pairwise 的平均值,並決定是否其中之一為0。
Tukey's test 的假設是1) 所有的observation 都是獨立的;2) 平均數是來自常態 ...
統計分析多重比較Multiplecomparisons275月| 4comments
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Writtenby researcher20在用ANOVA時,會得到一個F-test,這個test只能告訴你整個model是否顯著(i.e.,總體平均數不相同或不完全相同),並不能告訴你特定的組與組之間是否有差異。
有很多種方法可以比較組間的平均值是否有差異,這些方式就稱作多重比較(multiplecomparisons)(註:這裡只說事後比較,不提事前比較)。
那為什麼有這麼多種方式,不要有一種就好?好問題,因為問題的核心是TypeIerrors。
不同的方法有不同的假設與處理TypeIerrors的方式。
那為什麼問題的核心是TypeIerrors呢?因為就整個model的F-test來說,你只有一個比較,換言之,你只要處理一次TypeIerror即可。
但當你作多重比較時,你就要處理很多次TypeIerror(三組間的比較就要處理三次,四組就要六次),在這情況下,就要調整errorrate以免不小心犯了TypeIerror了。
如果要作posthoccomparisons(有人叫posterioritest),有許多選擇:1)Fisher’sLeastSignificantDifference(又稱為LSD);2)Tukey’sTest;3)TheRyanProcedure(REGWQ);4)TheSchefféTest;5)Dunnett’stestforcomparingalltreatmentswithacontrol。
會產生這麼多方法,主要是比較的方式不同。
有的方法是與均值作比較(i.e.,所有組別的平均皆相同),有的方法是配對比較(pairwisecomparison)(i.e.,與控制組比較、與最佳組比較),有的是contrast(特定兩組比較)。
LSD(最小差異)
簡化比較步驟,臨界值最小,最易顯著(也表示較容易犯TypeIerror)。
LSD要在整體模組F-test顯著的情況下才行。
Tukey’sTest(又稱為Tukey’sHonestlySignificantDifferenceTest,或簡稱為Tukey’sHSD)
TukeyHSD是測試所有可能的pairwise的平均值,並決定是否其中之一為0。
Tukey’stest的假設是1)所有的observation都是獨立的;2)平均數是來自常態分佈的樣本;3)同質性(equalvariationacrossobservations);4)equalsamplesizes(參見Wikipedia)。
如果樣本數不同,用Tukey–Kramermethod。
REGWQ
(待補充)
SchefféTest(雪費檢定;同步檢定法)
同時測試所有可能的contrast,並視是否其中之一為0。
臨界值最大,最不容易顯著(也表示較不容易犯TypeIIerror)。
可用於各組人數不同、非常態分配上。
Dunnett’stest
如果是比較所有的treatment跟control,建議用此種方法。
比較表(出自StatisticalmethodsforPsychologybyDavidC.Howell,第六版,頁375):
Test
Errorrate
Comparison
Type
事前/事後
備註
Individualttests
PCa
Pairwise
t
事前
Linearcontrast
PC
Anycontrasts
F
事前
Bonferronit
FWb
Anycontrasts
t**
事前
Holm:Larzelere&Mulaik
FWb
Anycontrasts
t**
兩者
Fisher’sLSD
FW*
Pairwise
t
事後
Newman-Keulstest
FW*
Pairwise
Range
事後
爭議性大
Ryan(REGWQ)
FW
Pairwise
Range
事後
TukeyHSD
FW
Pairwise***
Range
事後
只想測試某兩組時
SchefféTest
FW
Anycontrasts
F**
事後
想測試所有差異時
Dunnett’stest
FW
Withcontrol
F**
事後
Note:a:Errorratepercomparison.b:Familyerrorrate(FW). FW*:againstcompletenullhypothesis.t**:modifiedttest.F*:modified.Pairwise***:TukeyHSDcanbeusedforallcontrasts,butispoorforthispurpose.
請高手補充與指正!
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