如何讓Gaussian 計算飛起來? - 人人焦點

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量化計算無伺服器解決方案,. 零投入,三分鐘讓你的Gaussian 計算飛起來! 1.量化計算如何選擇硬體配置. 由於分子的類型、體系和 ... 人人焦點 影視 健康 歷史 數碼 遊戲 美食 時尚 旅遊 運動 星座 情感 動漫 科學 寵物 家居 文化 教育 故事 如何讓Gaussian計算飛起來? 2021-01-11Cloudam雲端 「量化窮三代,計算毀一生」?量化計算的硬體配置什麼最重要?不花冤枉錢,3萬元內性價比最高的硬體推薦!學校的計算節點永遠要排隊?研究所的數據中心算力不足?量化計算無伺服器解決方案,零投入,三分鐘讓你的Gaussian計算飛起來!1.量化計算如何選擇硬體配置由於分子的類型、體系和模擬算法,以及各種應用和精度要求,都有不同的計算特點,對計算機硬體(CPU、內存、硬碟、GPU)配置要求有很大的差異,如何選擇好伺服器/工作站的硬體配置,提高計算速度,縮短求解時間,主要看用量子化學計算軟體的算法,及做什麼求解,因爲算法和精度決定了計算特點和求解規模,合理的硬體配置,大大發揮機器性能,縮短求解時間。

1.1量子化學算法、精度與計算成本1.2原子體系規模、算法及硬體配置特點1.3Gaussian軟體的多核並行計算測試(1)基於Gaussian09版本這個測試分別用4核、8核、16核、32核、64核進行求解,從計算結果看,多核並行加速比很理想。

(2)基於Gaussian16版本多核並行計算測試以上數據來源:https://www.hpc.co.jp/library/benchmark/benchmark20150706/這個測試分別對8核、16核、32核、44核進行求解,從計算結果看,多核並行加速比到32核很理想,44核已經對求解沒有多大提升了。

1.4量子化學計算硬體配置特點(1)不同算法的並行計算的核數加速比有所差異,不完全是線性的(2)最新CPU架構和提升頻率,對縮短求解時間非常顯著(3)精度高求解計算量大,對CPU頻率和核數、內存容量、硬碟io要求均有很高要求數據來源:http://www.hpc.co.jp/chem/c_select_hardware.html(4)核數與內存比例爲1:4最爲理想(5)支持TeslaK40或K80的GPU計算,顯存需12GB以上(6)組成集羣的計算節點配置最好採用4核~10核超高頻,效率最高2.基於量子化學計算的硬體配置推薦2.1雙路伺服器配置推薦推薦理由:中端配置的機型,能應對多數Gaussian的應用環境,兼顧HF等內存消耗大的任務。

固態硬碟的加入是爲了應對需要大量頻繁讀寫硬碟的後HF任務。

如以DFT爲主,則可以去掉固態硬碟。

2.2高端雙路伺服器推薦推薦理由:該款CPU擁有多達28核2.0G頻率,可睿頻至2.7G。

其多核並行計算能力能滿足絕大多數計算化學領域的應用需求。

而如果你有GROMACS、AMBER、NAMD、Lammps等支持GPU加速的分子動力學應用需求,則至少需要額外增加RTX2080型號的顯卡。

當然,配備Titan甚至Tesla會有更好的性能,但從性價比考慮並不是很划算。

3.無伺服器解決方案儘管以上兩種硬體配置已經可以應對一般的量化計算應用場景,但隨著軟體、模型、計算機技術的不斷發展,量化計算對於算力的要求也越來越高,傳統的伺服器經常面臨算得慢、算得貴等問題,在需要爭分奪秒的科研競賽中顯得力不從心。

即使是擁有計算中心或超算節點的高校、科研機構和大型科技企業,由於需要服務的人員與項目衆多,也經常需要排隊等待計算資源。

簡單地總結一下,我們發現在量化計算中關於算力需求與當前的實際情況之間形成的矛盾主要有以下幾種:1、算力不足,導致算得慢;2、計算節點同時服務的項目有限,導致需要排隊;3、成本高昂,建立大型計算中心一次性投入巨大,且後期維護成本高昂;4、彈性不足,閒時資源浪費與忙時算力不足的情況交替發生。

那是否有一種方案,即不需要大規模投入和高昂的維護成本,又可以像使用本地機一樣方便地調用大量算力;既能保證算力需求峯值的算力供應,又無需負擔閒時的閒置成本;既能低成本計算普通的任務,也能通過調用大量資源加速完成計算任務?有,這就是被稱爲「量化計算無伺服器解決方案的「雲E彈性算力平台!雲E是基於公有雲的高性能計算雲平台。

通過對阿里雲、騰訊雲、AWS、微軟雲、谷歌雲等五大主流公有雲的資源整合,配合獨有的並行計算調度管理模塊,雲E能爲用戶快速構建與安裝部署一個「獨享式「雲端超算中心資源。

與傳統超算中心以及自建HPC集羣相比,雲E提供了一種快捷、彈性、經濟、安全的公共雲高性能計算服務。

首先,該服務不需要前期投入與運維成本,可以按需購買,即買即用。

雲E在全球擁有25個地域節點,超過10萬台伺服器,整合海量雲端異構資源,提供目前最先進的CPU及GPU在內的多種型號計算資源。

雲E可在10分鐘內啓動上萬台伺服器資源,也可在計算完成後立即關閉,是目前彈性最好的高性能計算雲平台。

爲用戶省去了排隊等待時間,也能根據用戶需要大大加速計算進度。

例如在之前的文章《用FLAREFEP計算相對結合自由能》中就進行過對比測試,測試表示使用雲E彈性算力平台進行GPU加速,在計算成本不變的前提下,計算速度可以上百倍的提升。

其次,雲E通過大規模採購及計算性能優化,能大幅降低資源使用成本。

目前雲E的CPU使用成本低至0.08元/核時。

再次,雲E預集成了Gaussian、GAMESS、NWChem、VirtulFlow等多種量化計算主流框架或軟體,開箱即用,讓使用者只需專注於專業本身,無需再爲硬體設備的配置及部署費心費力。

雲E彈性算力平台具有彈性、便捷、經濟等諸多優勢,能夠幫助使用者提高計算效率、降低計算成本。

目前已有衆多高校、科研機構開始使用雲E作爲量化計算雲平台。

雲E已經幫助使用者完成很多量化計算項目,如VirtualFlow超高通量虛擬篩選、用FLAREFEP計算相對結合自由能、VINA分子對接等。

我們期待爲更多用戶帶來更好的高性能計算體驗。

最新雲端軟體馮建新:力推硬科技發展,打造高性能雲計算「新基建」《藥物開發中的人工智慧:現狀與未來展望(上)》《藥物開發中的人工智慧:現狀與未來展望(下)》技術側鏈虛擬篩選:全PDB和ChEMBL數據分析VirtualFlow實現超高通量虛擬篩選用FLAREFEP計算相對結合自由能關於雲端深圳雲端軟體有限公司(Cloudam)是彈性算力與雲成本優化的技術領導者,爲企業打造一站式的算力雲平台及自動化雲成本優化服務。

雲端軟體推出的雲E算力平台整合了全球主流公有雲近50個地域的高性能計算資源,能爲人工智慧、仿真模擬、生物科技、材料化學等行業提供彈性、高效、經濟的算力支持。

Cloudam成立於瑞典斯德哥爾摩,在深圳及斯德哥爾摩兩地運營,團隊核心成員來自於Oracle、Ericsson、IBM、華爲等知名企業,擁有15年以上的世界500強企業技術服務經驗和研發背景,已成功爲歐洲及中國多家企業提供產品和技術服務。

分享、在看與點讚了解更多高性能計算與雲的知識 相關焦點 「量化計算教程」量化計算(Gaussian09) 用途採用Gaussian09程序進行量子化學計算。

已實現的作業類型包括:單點能、幾何優化、振動頻率、ECD/UV、NMR、比旋光度計算。

入口平台地址:https://cloud.yinfotek.com/功能入口:平台左側菜單欄【計算方案】->【大方案】->【量化計算】->【量化計算(Gaussian09)】步驟1.上傳分子結構文件上傳具有良好3D結構的分子文件,支持mol、mol2、pdb、sdf和sd格式。

多少氫氣球可以讓自行車飛起來 這時候孩子就會問了:爲什麼氣球會飛走呢?大人就會告訴孩子:氣球裡面是氫氣,會比空氣還輕,所以就會往上飄。

孩子又會追問:那會飛到天上去嗎?這時候你該如何回答給孩子,才能讓孩子更加明白其中的原因呢?1:氫氣球爲什麼會飄起來?是因爲氫氣是世界上已知最輕的氣體。

量子化學計算Gaussian理論與實戰培訓班 、熱力學性質、反應路徑等越來越多的問題困擾著廣大科研人員,Gaussian軟體是目前計算化學領域內流行、應用範圍廣的綜合性量子化學計算程序包,廣泛的被全世界各地的化學家、化學工程師、生物化學家、物理學家和其他學科的科學家們使用。

飛書:讓一部分團隊先飛起來 —飛書未來無限大會。

2最大的殘忍是放過自己字節跳動爲什麼要做飛書?謝欣在無限大會中說要從字節跳動成立的第一天說起……總結起來就是字節跳動的霸氣心聲——用遍了當時全世界最好的產品,並沒得到最好的反應。

謝欣跟張一鳴一合計,乾脆自己動手做。

【PhysicsWorld】QuantumadvantagedemonstratedusingGaussian... 03Dec2020HamishJohnstonhttps://physicsworld.com/a/quantum-advantage-demonstrated-using-gaussian-boson-sampling/ 飛機那麼重,爲什麼能飛起來? 飛機那麼大,爲什麼能飛起來?  我們每個人都見過大飛機,而且相信每個人通過我們初中的知識就可以簡單的解釋飛機是如何飛起來的,但飛機真的僅僅是依靠所謂的上下翼面的壓差飛起來的?  帶著這個問題,我們做簡單分析,僅供交流思考。

  1、升力如何產生? 送貨單軟體如何自定義計算公式? 信管飛RMS(進銷存管理軟體)、信管飛送貨單軟體、信管飛倉庫管理軟體等開單默認是根據單價*數量自動計算得出金額,如有其他的數據計算需求,軟體也支持自定義計算公式,本篇文章以送貨單軟體爲例介紹一下如何自定義計算公式? 飛機爲什麼能飛起來,竟然至今還是個未解之謎 但是你知道嗎,從100年前到今天,「飛機爲什麼能飛起來」至今是個未解之謎!1兩個經典理論中的漏洞衆所周知飛機是因爲有升力飛起來,但是升力是如何產生的?有兩個理論可以解釋升力的產生,但是他們都有一些漏洞。

飛機爲什麼能飛起來,其實至今仍然是個未解之謎! 但是你知道嗎,從100年前到今天,「飛機爲什麼能飛起來」至今還是個未解之謎!兩個經典理論中的漏洞衆所周知飛機是因爲有升力飛起來,但是升力是如何產生的?有兩個理論可以解釋升力的產生,但是他們都有一些漏洞。

飛機爲什麼能飛起來,竟然至今還是個未解之謎 但是你知道嗎,從100年前到今天,「飛機爲什麼能飛起來」至今是個未解之謎!1.兩個經典理論中的漏洞衆所周知飛機是因爲有升力飛起來,但是升力是如何產生的?有兩個理論可以解釋升力的產生,但是他們都有一些漏洞。

這個小蟲子提前飛起來了!泰州人您知道如何防治呢?快看看! 不過,今年,這個小蟲子白蟻也提前飛起來了!泰州人您知道如何防治呢?下面,我們快來一起了解一下喲!氣溫升高白蟻蠢蠢欲動「請你們快來看看,我家裡好像有不少白蟻。

」家住泰州市海陵區華港鎮的李奶奶撥打了泰州市白蟻防治所電話。

工作人員到現場勘察之後,初步確認爲黃胸散白蟻。

白蟻紛飛,目的是遷徙、分羣、繁殖。

Gaussian爲您打造量子化學計算的「超級大腦」 來源:深圳超算自1946年第一台電子計算機ENIAC現世以來,高性能計算機已經經歷了三次大的發展階段,分別以電子器件、系統結構和計算模式的重大變革作爲階段發展的標誌。

而說到高性能計算的時候,我們第一反應能夠想到的,往往是類似於深圳超算中心配置的超級計算機,卻總是會忽略在上面跑的軟體。

NMR化學位移和耦合常數計算簡介 本文簡單介紹一下怎麼用高斯的DFT計算NMR化學位移和耦合常數,以及如何在GaussView里觀看計算生成的圖譜。

蘇學成:機器人鳥是怎麼飛起來的? 最後選定了鴿子,它飛得快,更重要的是它認家,飛出去還會回來,可以反覆使用,所以自古就有信鴿。

一開始我們按照控制老鼠的辦法,考慮到鴿子沒鬍鬚,根據神經學,按照機器人鼠的原理,在鴿腦中找了很多與老鼠鬍鬚功能近似的腦區,經過無數次的嘗試和反覆實驗,都不行。

總之,用上述控制機器人鼠的方法無法控制鴿子。

事情往往有兩面性。

身高超過2米,被稱全球最大的鷹,它是如何飛起來的? 最大的老虎體型可達3米,奔跑起來最大時速有80公里每小時。

不過在人類的干預下,野生動物的生存環境越來越惡劣,即便是如此兇猛的野獸也會面臨捕殺的危機。

如今地球上最大的哺乳動物爲藍鯨,成年藍鯨體長超過30米,重達180噸,相當於26頭成年非洲大象。

2012年藍鯨被列爲瀕危物種,說過了地上跑的水裡游的,再來說說天上飛的。

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這個原理也成爲了目前解釋「飛機爲什麼能飛起來」的非技術性理論。

然而,伯努利原理本身並不能完全解釋升力,它有三個漏洞:第一,儘管實際經驗表明,在彎曲的表面上空氣流動的速度確實更快,但伯努利原理卻無法解釋爲什麼會出現流速變快的現象。

用Gaussian16計算振動分辨的紫外-可見吸收光譜 在高斯中,可以使用Frank-Condon分析的功能來實現振動分辨的電子光譜的計算,其具體原理可參見Vibrationally-resolvedelectronicspectrainGAUSSIAN09一文(點擊文末閱讀原文)。

二、計算實例本文以吸收光譜爲例,介紹計算過程。

推車0520:如何準確的撞飛一輛公交車 推車0520:如何準確的撞飛一輛公交車2016年05月20日08:53作者:呂亞飛編輯:呂亞飛文章出處:泡泡網原創大家坐好了,每天早上8點整我們準時發車今年過了年之後,鬥氣車似乎突然之間多了起來。

從年初的比亞迪唐裝翻大衆朗逸,再到成都牧馬人大戰高爾夫,鬥氣車主們戰的不亦樂乎。

而最近,公交車司機,也加入了戰團。



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